В этом конкурсе университет традиционно принимает участие на протяжении нескольких лет.
Церемония награждения лауреатов конкурса прошла с 1 по 4 апреля 2016 года в Санкт-Петербурге в рамках IX Всероссийской конференции «Проблемы и перспективы развития высшего образования и науки в Российской Федерации».
По итогам конкурса Сахалинский государственный университет признан победителем в номинации «100 лучших вузов России», за что награжден дипломом и золотой медалью.
Помимо золотой медали, университет получил еще призовые места в двух номинациях: «Наиболее значимое событие в вузовской жизни» (открытие нового учебно-лабораторного корпуса СахГУ) и «Лучший вуз в области партнерства науки и производства» (финансирование и выполнение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ в СахГУ для предприятий-заказчиков за 2015 год).
Конференция по развитию образования проводится в Петербурге с 2004 года, и к настоящему времени среди руководителей научно-исследовательских институтов, ректоров вузов, экспертов и специалистов в области науки и образования признана одним из ключевых событий. Это дискуссионная площадка для обмена мнениями руководителей образовательных и научных учреждений с законодателями из Совета Федерации и Государственной думы.
С 2010 года председателем конференции является лауреат Нобелевской премии, академик РАН, вице-президент РАН Жорес Алферов.
Основной целью конкурса «100 лучших вузов и НИИ России» является поддержка усилий руководителей государственных и негосударственных вузов, институтов Российской академии наук, а также проектных, конструкторских и технологических организаций страны по развитию передовых и инновационных технологий и совершенствованию научных исследований и разработок.
Основой для оценки успешности работы вуза служит разработанная оргкомитетом «Модель оценки вуза», которая включает в себя целый ряд критериев.
В работе конференции и финальной части конкурса приняли участие около 140 человек более чем из 50 регионов страны.